Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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