Protein–RNA interactions for Protein: Q1RNF8

Samd11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd11Q1RNF8 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 Pcnp-203ENSMUST00000119981 901 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 Gm22442-201ENSMUST00000157256 144 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 Mrpl23-206ENSMUST00000210662 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 Zcwpw2-202ENSMUST00000187329 1469 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 Rfc4-202ENSMUST00000115337 416 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Samd11Q1RNF8 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 AC174797.2-202ENSMUST00000225729 568 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 AC154176.1-201ENSMUST00000225897 220 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Samd11Q1RNF8 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Samd11Q1RNF8 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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