Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

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Length 625 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Traf3ip1Q149C2 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Traf3ip1Q149C2 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Traf3ip1Q149C2 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Traf3ip1Q149C2 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Traf3ip1Q149C2 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Traf3ip1Q149C2 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Traf3ip1Q149C2 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Traf3ip1Q149C2 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Traf3ip1Q149C2 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Traf3ip1Q149C2 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Traf3ip1Q149C2 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Traf3ip1Q149C2 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Traf3ip1Q149C2 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Traf3ip1Q149C2 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Traf3ip1Q149C2 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Traf3ip1Q149C2 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Traf3ip1Q149C2 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Traf3ip1Q149C2 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Traf3ip1Q149C2 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Traf3ip1Q149C2 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Traf3ip1Q149C2 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Traf3ip1Q149C2 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Traf3ip1Q149C2 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Traf3ip1Q149C2 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Traf3ip1Q149C2 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Traf3ip1Q149C2 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Traf3ip1Q149C2 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Traf3ip1Q149C2 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Traf3ip1Q149C2 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Traf3ip1Q149C2 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Traf3ip1Q149C2 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Traf3ip1Q149C2 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Traf3ip1Q149C2 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Traf3ip1Q149C2 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Traf3ip1Q149C2 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Traf3ip1Q149C2 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Traf3ip1Q149C2 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Traf3ip1Q149C2 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Traf3ip1Q149C2 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Traf3ip1Q149C2 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Traf3ip1Q149C2 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Traf3ip1Q149C2 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Traf3ip1Q149C2 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Traf3ip1Q149C2 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Traf3ip1Q149C2 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Traf3ip1Q149C2 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
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Traf3ip1Q149C2 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Traf3ip1Q149C2 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Traf3ip1Q149C2 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
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Traf3ip1Q149C2 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Traf3ip1Q149C2 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
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Traf3ip1Q149C2 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Traf3ip1Q149C2 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Traf3ip1Q149C2 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
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Traf3ip1Q149C2 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Traf3ip1Q149C2 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Traf3ip1Q149C2 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
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Traf3ip1Q149C2 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Traf3ip1Q149C2 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Traf3ip1Q149C2 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Traf3ip1Q149C2 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Traf3ip1Q149C2 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
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Traf3ip1Q149C2 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Traf3ip1Q149C2 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Traf3ip1Q149C2 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Traf3ip1Q149C2 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Traf3ip1Q149C2 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Traf3ip1Q149C2 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Traf3ip1Q149C2 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Traf3ip1Q149C2 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Traf3ip1Q149C2 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Traf3ip1Q149C2 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Traf3ip1Q149C2 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Traf3ip1Q149C2 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Traf3ip1Q149C2 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Traf3ip1Q149C2 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Traf3ip1Q149C2 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Traf3ip1Q149C2 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Traf3ip1Q149C2 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Traf3ip1Q149C2 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Traf3ip1Q149C2 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Traf3ip1Q149C2 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Traf3ip1Q149C2 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Traf3ip1Q149C2 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Traf3ip1Q149C2 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Traf3ip1Q149C2 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Traf3ip1Q149C2 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Traf3ip1Q149C2 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Traf3ip1Q149C2 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Traf3ip1Q149C2 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Traf3ip1Q149C2 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
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