Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

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Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc39dQ0VF76 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc39dQ0VF76 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc39dQ0VF76 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc39dQ0VF76 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc39dQ0VF76 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc39dQ0VF76 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc39dQ0VF76 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc39dQ0VF76 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Ttc39dQ0VF76 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc39dQ0VF76 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc39dQ0VF76 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc39dQ0VF76 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc39dQ0VF76 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc39dQ0VF76 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Ttc39dQ0VF76 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc39dQ0VF76 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc39dQ0VF76 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc39dQ0VF76 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Ttc39dQ0VF76 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc39dQ0VF76 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Ttc39dQ0VF76 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc39dQ0VF76 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Ttc39dQ0VF76 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Ttc39dQ0VF76 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc39dQ0VF76 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Ttc39dQ0VF76 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc39dQ0VF76 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Ttc39dQ0VF76 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc39dQ0VF76 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Ttc39dQ0VF76 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc39dQ0VF76 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc39dQ0VF76 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Ttc39dQ0VF76 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc39dQ0VF76 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc39dQ0VF76 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Ttc39dQ0VF76 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Ttc39dQ0VF76 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Ttc39dQ0VF76 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Ttc39dQ0VF76 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Ttc39dQ0VF76 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc39dQ0VF76 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc39dQ0VF76 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc39dQ0VF76 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc39dQ0VF76 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc39dQ0VF76 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc39dQ0VF76 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc39dQ0VF76 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc39dQ0VF76 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc39dQ0VF76 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc39dQ0VF76 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc39dQ0VF76 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc39dQ0VF76 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc39dQ0VF76 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc39dQ0VF76 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc39dQ0VF76 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc39dQ0VF76 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc39dQ0VF76 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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