Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Itgb8Q0VBD0 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Itgb8Q0VBD0 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Itgb8Q0VBD0 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Itgb8Q0VBD0 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Itgb8Q0VBD0 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Itgb8Q0VBD0 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Itgb8Q0VBD0 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Itgb8Q0VBD0 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Itgb8Q0VBD0 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Itgb8Q0VBD0 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Itgb8Q0VBD0 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Itgb8Q0VBD0 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Itgb8Q0VBD0 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Itgb8Q0VBD0 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Itgb8Q0VBD0 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Itgb8Q0VBD0 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Itgb8Q0VBD0 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Itgb8Q0VBD0 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Itgb8Q0VBD0 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Itgb8Q0VBD0 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Itgb8Q0VBD0 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Itgb8Q0VBD0 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Itgb8Q0VBD0 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Itgb8Q0VBD0 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Itgb8Q0VBD0 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Itgb8Q0VBD0 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Itgb8Q0VBD0 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Itgb8Q0VBD0 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Itgb8Q0VBD0 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Itgb8Q0VBD0 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Itgb8Q0VBD0 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Itgb8Q0VBD0 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Itgb8Q0VBD0 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Itgb8Q0VBD0 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Itgb8Q0VBD0 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Itgb8Q0VBD0 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Itgb8Q0VBD0 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms