Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vps8Q0P5W1 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vps8Q0P5W1 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vps8Q0P5W1 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vps8Q0P5W1 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vps8Q0P5W1 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vps8Q0P5W1 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vps8Q0P5W1 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vps8Q0P5W1 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vps8Q0P5W1 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vps8Q0P5W1 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vps8Q0P5W1 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vps8Q0P5W1 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vps8Q0P5W1 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Vps8Q0P5W1 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Vps8Q0P5W1 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vps8Q0P5W1 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vps8Q0P5W1 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Vps8Q0P5W1 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vps8Q0P5W1 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vps8Q0P5W1 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Vps8Q0P5W1 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Vps8Q0P5W1 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vps8Q0P5W1 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Vps8Q0P5W1 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Vps8Q0P5W1 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Vps8Q0P5W1 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Vps8Q0P5W1 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Vps8Q0P5W1 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vps8Q0P5W1 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vps8Q0P5W1 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vps8Q0P5W1 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Vps8Q0P5W1 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Vps8Q0P5W1 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Vps8Q0P5W1 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vps8Q0P5W1 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Vps8Q0P5W1 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vps8Q0P5W1 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vps8Q0P5W1 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Vps8Q0P5W1 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vps8Q0P5W1 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Vps8Q0P5W1 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vps8Q0P5W1 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vps8Q0P5W1 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Vps8Q0P5W1 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vps8Q0P5W1 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Vps8Q0P5W1 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vps8Q0P5W1 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vps8Q0P5W1 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vps8Q0P5W1 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vps8Q0P5W1 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vps8Q0P5W1 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Vps8Q0P5W1 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vps8Q0P5W1 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vps8Q0P5W1 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Vps8Q0P5W1 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Vps8Q0P5W1 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Vps8Q0P5W1 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vps8Q0P5W1 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vps8Q0P5W1 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vps8Q0P5W1 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Vps8Q0P5W1 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vps8Q0P5W1 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vps8Q0P5W1 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vps8Q0P5W1 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vps8Q0P5W1 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vps8Q0P5W1 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vps8Q0P5W1 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vps8Q0P5W1 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vps8Q0P5W1 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Vps8Q0P5W1 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vps8Q0P5W1 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vps8Q0P5W1 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vps8Q0P5W1 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vps8Q0P5W1 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vps8Q0P5W1 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vps8Q0P5W1 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vps8Q0P5W1 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vps8Q0P5W1 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vps8Q0P5W1 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Vps8Q0P5W1 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vps8Q0P5W1 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vps8Q0P5W1 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vps8Q0P5W1 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vps8Q0P5W1 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vps8Q0P5W1 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Vps8Q0P5W1 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vps8Q0P5W1 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Vps8Q0P5W1 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Vps8Q0P5W1 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vps8Q0P5W1 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vps8Q0P5W1 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vps8Q0P5W1 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Vps8Q0P5W1 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Vps8Q0P5W1 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vps8Q0P5W1 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vps8Q0P5W1 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vps8Q0P5W1 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vps8Q0P5W1 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vps8Q0P5W1 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms