Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
TrioQ0KL02 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
TrioQ0KL02 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
TrioQ0KL02 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
TrioQ0KL02 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
TrioQ0KL02 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
TrioQ0KL02 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TrioQ0KL02 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TrioQ0KL02 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TrioQ0KL02 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TrioQ0KL02 E330034L11Rik-201ENSMUST00000200640 1742 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
TrioQ0KL02 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TrioQ0KL02 Tsc22d3-204ENSMUST00000123898 952 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
TrioQ0KL02 AC170997.1-201ENSMUST00000214554 1053 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TrioQ0KL02 Prss3-201ENSMUST00000096003 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TrioQ0KL02 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
TrioQ0KL02 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TrioQ0KL02 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TrioQ0KL02 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
TrioQ0KL02 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TrioQ0KL02 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TrioQ0KL02 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
TrioQ0KL02 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TrioQ0KL02 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TrioQ0KL02 Ighv5-9-201ENSMUST00000103448 418 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
TrioQ0KL02 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
TrioQ0KL02 Zfp961-203ENSMUST00000132848 781 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
TrioQ0KL02 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
TrioQ0KL02 Isoc2b-205ENSMUST00000208816 820 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
TrioQ0KL02 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
TrioQ0KL02 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TrioQ0KL02 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TrioQ0KL02 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TrioQ0KL02 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
TrioQ0KL02 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC12.4□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 Tomm5-201ENSMUST00000107807 442 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 AC154361.2-201ENSMUST00000224747 943 ntBASIC12.4□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 Ccna1-204ENSMUST00000198320 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 Art5-202ENSMUST00000106934 843 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 P4htm-204ENSMUST00000193621 1297 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 D3Ertd751e-204ENSMUST00000119572 1011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 Gm43854-201ENSMUST00000200418 394 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 Gm18294-201ENSMUST00000176980 1748 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 Fam187b-203ENSMUST00000129773 1213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 Gm12000-201ENSMUST00000132007 629 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 Gm39288-201ENSMUST00000210554 446 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 Mustn1-201ENSMUST00000040715 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 3100002H09Rik-201ENSMUST00000053604 873 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms