Protein–RNA interactions for Protein: Q08874

Mitf, Microphthalmia-associated transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MitfQ08874 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
MitfQ08874 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
MitfQ08874 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
MitfQ08874 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
MitfQ08874 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
MitfQ08874 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
MitfQ08874 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
MitfQ08874 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms