Protein–RNA interactions for Protein: Q08091

Cnn1, Calponin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn1Q08091 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
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Cnn1Q08091 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cnn1Q08091 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cnn1Q08091 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cnn1Q08091 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cnn1Q08091 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cnn1Q08091 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cnn1Q08091 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cnn1Q08091 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cnn1Q08091 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cnn1Q08091 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cnn1Q08091 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cnn1Q08091 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cnn1Q08091 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cnn1Q08091 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cnn1Q08091 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cnn1Q08091 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cnn1Q08091 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cnn1Q08091 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cnn1Q08091 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cnn1Q08091 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cnn1Q08091 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cnn1Q08091 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cnn1Q08091 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cnn1Q08091 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cnn1Q08091 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cnn1Q08091 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cnn1Q08091 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cnn1Q08091 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cnn1Q08091 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cnn1Q08091 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cnn1Q08091 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cnn1Q08091 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Cnn1Q08091 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
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Cnn1Q08091 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cnn1Q08091 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cnn1Q08091 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cnn1Q08091 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cnn1Q08091 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cnn1Q08091 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cnn1Q08091 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cnn1Q08091 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cnn1Q08091 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cnn1Q08091 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cnn1Q08091 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cnn1Q08091 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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Cnn1Q08091 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cnn1Q08091 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cnn1Q08091 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cnn1Q08091 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cnn1Q08091 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cnn1Q08091 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cnn1Q08091 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cnn1Q08091 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cnn1Q08091 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cnn1Q08091 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cnn1Q08091 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Cnn1Q08091 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cnn1Q08091 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Cnn1Q08091 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cnn1Q08091 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cnn1Q08091 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cnn1Q08091 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cnn1Q08091 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Cnn1Q08091 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cnn1Q08091 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cnn1Q08091 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cnn1Q08091 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Cnn1Q08091 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cnn1Q08091 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cnn1Q08091 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cnn1Q08091 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cnn1Q08091 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cnn1Q08091 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cnn1Q08091 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
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