Protein–RNA interactions for Protein: Q02738

Gjb4, Gap junction beta-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb4Q02738 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Gjb4Q02738 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Gjb4Q02738 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gjb4Q02738 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gjb4Q02738 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Gjb4Q02738 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gjb4Q02738 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gjb4Q02738 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gjb4Q02738 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Gjb4Q02738 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gjb4Q02738 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Gjb4Q02738 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gjb4Q02738 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gjb4Q02738 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gjb4Q02738 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gjb4Q02738 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gjb4Q02738 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gjb4Q02738 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gjb4Q02738 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gjb4Q02738 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gjb4Q02738 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gjb4Q02738 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gjb4Q02738 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gjb4Q02738 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gjb4Q02738 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gjb4Q02738 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gjb4Q02738 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gjb4Q02738 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gjb4Q02738 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gjb4Q02738 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gjb4Q02738 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gjb4Q02738 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gjb4Q02738 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gjb4Q02738 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gjb4Q02738 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gjb4Q02738 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Gjb4Q02738 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gjb4Q02738 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gjb4Q02738 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gjb4Q02738 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Gjb4Q02738 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gjb4Q02738 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Gjb4Q02738 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gjb4Q02738 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gjb4Q02738 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gjb4Q02738 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gjb4Q02738 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gjb4Q02738 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gjb4Q02738 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Gjb4Q02738 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Gjb4Q02738 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gjb4Q02738 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Gjb4Q02738 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Gjb4Q02738 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gjb4Q02738 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Gjb4Q02738 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gjb4Q02738 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gjb4Q02738 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gjb4Q02738 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gjb4Q02738 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gjb4Q02738 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gjb4Q02738 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gjb4Q02738 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gjb4Q02738 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gjb4Q02738 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gjb4Q02738 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gjb4Q02738 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gjb4Q02738 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gjb4Q02738 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Gjb4Q02738 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gjb4Q02738 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gjb4Q02738 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gjb4Q02738 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Gjb4Q02738 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Gjb4Q02738 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gjb4Q02738 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gjb4Q02738 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gjb4Q02738 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gjb4Q02738 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gjb4Q02738 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gjb4Q02738 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gjb4Q02738 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Gjb4Q02738 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gjb4Q02738 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gjb4Q02738 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Gjb4Q02738 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Gjb4Q02738 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gjb4Q02738 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gjb4Q02738 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Gjb4Q02738 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gjb4Q02738 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Gjb4Q02738 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC14□□□□□ -0.17
Gjb4Q02738 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gjb4Q02738 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Gjb4Q02738 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Gjb4Q02738 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Gjb4Q02738 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Gjb4Q02738 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Gjb4Q02738 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Gjb4Q02738 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms