Protein–RNA interactions for Protein: Q01149

Col1a2, Collagen alpha-2(I) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col1a2Q01149 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col1a2Q01149 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col1a2Q01149 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col1a2Q01149 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col1a2Q01149 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col1a2Q01149 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Col1a2Q01149 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Col1a2Q01149 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col1a2Q01149 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Col1a2Q01149 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Col1a2Q01149 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col1a2Q01149 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col1a2Q01149 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col1a2Q01149 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col1a2Q01149 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Col1a2Q01149 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col1a2Q01149 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Col1a2Q01149 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col1a2Q01149 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col1a2Q01149 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col1a2Q01149 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col1a2Q01149 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col1a2Q01149 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col1a2Q01149 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col1a2Q01149 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col1a2Q01149 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col1a2Q01149 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Col1a2Q01149 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col1a2Q01149 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col1a2Q01149 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col1a2Q01149 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col1a2Q01149 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col1a2Q01149 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col1a2Q01149 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col1a2Q01149 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col1a2Q01149 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Col1a2Q01149 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Col1a2Q01149 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col1a2Q01149 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col1a2Q01149 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col1a2Q01149 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Col1a2Q01149 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Col1a2Q01149 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Col1a2Q01149 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col1a2Q01149 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col1a2Q01149 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col1a2Q01149 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col1a2Q01149 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col1a2Q01149 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col1a2Q01149 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col1a2Q01149 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col1a2Q01149 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col1a2Q01149 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col1a2Q01149 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col1a2Q01149 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col1a2Q01149 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col1a2Q01149 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col1a2Q01149 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Col1a2Q01149 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col1a2Q01149 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col1a2Q01149 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col1a2Q01149 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col1a2Q01149 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col1a2Q01149 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col1a2Q01149 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col1a2Q01149 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col1a2Q01149 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Col1a2Q01149 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col1a2Q01149 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col1a2Q01149 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col1a2Q01149 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col1a2Q01149 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Col1a2Q01149 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Col1a2Q01149 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Col1a2Q01149 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Col1a2Q01149 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Col1a2Q01149 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Col1a2Q01149 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Col1a2Q01149 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col1a2Q01149 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col1a2Q01149 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col1a2Q01149 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col1a2Q01149 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col1a2Q01149 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Col1a2Q01149 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col1a2Q01149 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col1a2Q01149 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col1a2Q01149 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col1a2Q01149 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col1a2Q01149 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Col1a2Q01149 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col1a2Q01149 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col1a2Q01149 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Col1a2Q01149 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col1a2Q01149 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Col1a2Q01149 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col1a2Q01149 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col1a2Q01149 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col1a2Q01149 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col1a2Q01149 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.6 ms