Protein–RNA interactions for Protein: P97474

Pitx2, Pituitary homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx2P97474 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Pitx2P97474 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Pitx2P97474 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pitx2P97474 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pitx2P97474 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pitx2P97474 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pitx2P97474 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pitx2P97474 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pitx2P97474 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pitx2P97474 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pitx2P97474 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pitx2P97474 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Pitx2P97474 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pitx2P97474 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Pitx2P97474 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pitx2P97474 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pitx2P97474 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pitx2P97474 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pitx2P97474 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pitx2P97474 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pitx2P97474 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pitx2P97474 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pitx2P97474 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pitx2P97474 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pitx2P97474 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pitx2P97474 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pitx2P97474 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pitx2P97474 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pitx2P97474 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pitx2P97474 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pitx2P97474 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pitx2P97474 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.63
Pitx2P97474 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.63
Pitx2P97474 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Pitx2P97474 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Pitx2P97474 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pitx2P97474 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pitx2P97474 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pitx2P97474 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pitx2P97474 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pitx2P97474 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pitx2P97474 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pitx2P97474 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pitx2P97474 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Pitx2P97474 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pitx2P97474 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Pitx2P97474 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pitx2P97474 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pitx2P97474 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pitx2P97474 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pitx2P97474 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pitx2P97474 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pitx2P97474 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pitx2P97474 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Pitx2P97474 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pitx2P97474 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Pitx2P97474 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Pitx2P97474 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pitx2P97474 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pitx2P97474 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Pitx2P97474 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pitx2P97474 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pitx2P97474 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pitx2P97474 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pitx2P97474 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pitx2P97474 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pitx2P97474 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pitx2P97474 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pitx2P97474 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pitx2P97474 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pitx2P97474 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pitx2P97474 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pitx2P97474 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pitx2P97474 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pitx2P97474 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pitx2P97474 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pitx2P97474 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pitx2P97474 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pitx2P97474 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pitx2P97474 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pitx2P97474 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pitx2P97474 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pitx2P97474 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pitx2P97474 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pitx2P97474 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pitx2P97474 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pitx2P97474 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pitx2P97474 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pitx2P97474 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pitx2P97474 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pitx2P97474 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pitx2P97474 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pitx2P97474 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pitx2P97474 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pitx2P97474 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pitx2P97474 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pitx2P97474 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pitx2P97474 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pitx2P97474 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pitx2P97474 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms