Protein–RNA interactions for Protein: P97432

Nbr1, Next to BRCA1 gene 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 988 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nbr1P97432 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nbr1P97432 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nbr1P97432 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Nbr1P97432 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nbr1P97432 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Nbr1P97432 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Nbr1P97432 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Nbr1P97432 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Nbr1P97432 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Nbr1P97432 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Nbr1P97432 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Nbr1P97432 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nbr1P97432 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nbr1P97432 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nbr1P97432 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nbr1P97432 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nbr1P97432 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nbr1P97432 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nbr1P97432 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nbr1P97432 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nbr1P97432 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nbr1P97432 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nbr1P97432 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nbr1P97432 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Nbr1P97432 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nbr1P97432 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Nbr1P97432 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nbr1P97432 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nbr1P97432 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Nbr1P97432 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Nbr1P97432 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Nbr1P97432 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Nbr1P97432 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nbr1P97432 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nbr1P97432 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nbr1P97432 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nbr1P97432 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Nbr1P97432 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Nbr1P97432 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nbr1P97432 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nbr1P97432 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nbr1P97432 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nbr1P97432 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nbr1P97432 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nbr1P97432 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nbr1P97432 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Nbr1P97432 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nbr1P97432 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nbr1P97432 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nbr1P97432 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nbr1P97432 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nbr1P97432 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nbr1P97432 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nbr1P97432 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nbr1P97432 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nbr1P97432 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nbr1P97432 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nbr1P97432 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nbr1P97432 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nbr1P97432 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nbr1P97432 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Nbr1P97432 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Nbr1P97432 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nbr1P97432 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nbr1P97432 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Nbr1P97432 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nbr1P97432 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nbr1P97432 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nbr1P97432 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nbr1P97432 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nbr1P97432 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nbr1P97432 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nbr1P97432 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nbr1P97432 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nbr1P97432 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nbr1P97432 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nbr1P97432 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nbr1P97432 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nbr1P97432 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nbr1P97432 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nbr1P97432 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nbr1P97432 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nbr1P97432 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nbr1P97432 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nbr1P97432 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nbr1P97432 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nbr1P97432 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nbr1P97432 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nbr1P97432 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nbr1P97432 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Nbr1P97432 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nbr1P97432 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Nbr1P97432 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nbr1P97432 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Nbr1P97432 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nbr1P97432 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nbr1P97432 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nbr1P97432 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Nbr1P97432 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nbr1P97432 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms