Protein–RNA interactions for Protein: P97355

Sms, Spermine synthase, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmsP97355 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SmsP97355 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SmsP97355 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SmsP97355 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SmsP97355 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SmsP97355 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SmsP97355 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SmsP97355 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SmsP97355 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
SmsP97355 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SmsP97355 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SmsP97355 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SmsP97355 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SmsP97355 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SmsP97355 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SmsP97355 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
SmsP97355 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
SmsP97355 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
SmsP97355 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SmsP97355 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SmsP97355 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
SmsP97355 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
SmsP97355 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
SmsP97355 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SmsP97355 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
SmsP97355 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SmsP97355 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
SmsP97355 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SmsP97355 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SmsP97355 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SmsP97355 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SmsP97355 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SmsP97355 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
SmsP97355 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SmsP97355 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SmsP97355 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SmsP97355 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SmsP97355 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SmsP97355 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SmsP97355 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SmsP97355 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SmsP97355 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
SmsP97355 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
SmsP97355 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SmsP97355 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SmsP97355 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SmsP97355 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SmsP97355 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SmsP97355 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
SmsP97355 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
SmsP97355 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SmsP97355 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SmsP97355 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SmsP97355 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SmsP97355 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SmsP97355 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SmsP97355 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SmsP97355 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SmsP97355 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SmsP97355 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SmsP97355 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SmsP97355 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
SmsP97355 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
SmsP97355 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
SmsP97355 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
SmsP97355 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SmsP97355 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SmsP97355 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SmsP97355 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SmsP97355 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SmsP97355 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SmsP97355 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SmsP97355 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SmsP97355 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SmsP97355 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SmsP97355 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SmsP97355 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SmsP97355 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SmsP97355 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SmsP97355 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SmsP97355 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SmsP97355 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SmsP97355 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SmsP97355 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SmsP97355 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SmsP97355 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SmsP97355 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SmsP97355 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SmsP97355 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SmsP97355 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SmsP97355 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SmsP97355 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SmsP97355 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SmsP97355 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SmsP97355 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SmsP97355 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SmsP97355 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SmsP97355 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SmsP97355 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SmsP97355 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.1 ms