Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pkp1P97350 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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