Protein–RNA interactions for Protein: P70399

Tp53bp1, TP53-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,969 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tp53bp1P70399 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Tp53bp1P70399 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Tp53bp1P70399 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Tp53bp1P70399 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Tp53bp1P70399 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Tp53bp1P70399 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Tp53bp1P70399 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Tp53bp1P70399 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Tp53bp1P70399 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Tp53bp1P70399 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Tp53bp1P70399 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tp53bp1P70399 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tp53bp1P70399 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tp53bp1P70399 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Tp53bp1P70399 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tp53bp1P70399 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tp53bp1P70399 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tp53bp1P70399 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tp53bp1P70399 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tp53bp1P70399 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tp53bp1P70399 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Tp53bp1P70399 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Tp53bp1P70399 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tp53bp1P70399 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Tp53bp1P70399 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tp53bp1P70399 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tp53bp1P70399 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tp53bp1P70399 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tp53bp1P70399 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tp53bp1P70399 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tp53bp1P70399 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tp53bp1P70399 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tp53bp1P70399 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tp53bp1P70399 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tp53bp1P70399 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tp53bp1P70399 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tp53bp1P70399 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tp53bp1P70399 Gm12795-201ENSMUST00000117594 539 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Tp53bp1P70399 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
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Tp53bp1P70399 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tp53bp1P70399 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tp53bp1P70399 Gm3028-201ENSMUST00000213805 1119 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Tp53bp1P70399 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tp53bp1P70399 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Tp53bp1P70399 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tp53bp1P70399 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tp53bp1P70399 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tp53bp1P70399 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tp53bp1P70399 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tp53bp1P70399 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Tp53bp1P70399 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tp53bp1P70399 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tp53bp1P70399 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tp53bp1P70399 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tp53bp1P70399 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tp53bp1P70399 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tp53bp1P70399 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Tp53bp1P70399 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Tp53bp1P70399 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Tp53bp1P70399 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tp53bp1P70399 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tp53bp1P70399 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tp53bp1P70399 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tp53bp1P70399 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Tp53bp1P70399 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tp53bp1P70399 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tp53bp1P70399 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tp53bp1P70399 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tp53bp1P70399 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tp53bp1P70399 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tp53bp1P70399 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tp53bp1P70399 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tp53bp1P70399 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tp53bp1P70399 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tp53bp1P70399 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tp53bp1P70399 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tp53bp1P70399 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tp53bp1P70399 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tp53bp1P70399 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tp53bp1P70399 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tp53bp1P70399 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tp53bp1P70399 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tp53bp1P70399 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tp53bp1P70399 Gm13047-201ENSMUST00000117116 815 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Tp53bp1P70399 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tp53bp1P70399 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Tp53bp1P70399 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tp53bp1P70399 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tp53bp1P70399 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Tp53bp1P70399 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tp53bp1P70399 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tp53bp1P70399 Gm34809-203ENSMUST00000222945 509 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
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