Protein–RNA interactions for Protein: P70398

Usp9x, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9xP70398 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Gm12030-201ENSMUST00000121917 223 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Gm24248-201ENSMUST00000157321 322 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Gm22442-201ENSMUST00000157256 144 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Mc5r-201ENSMUST00000172148 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Zfp655-203ENSMUST00000196069 1150 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Gm7972-202ENSMUST00000208453 505 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 CT573086.4-201ENSMUST00000226729 342 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Gm5805-201ENSMUST00000072779 456 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Prss55-201ENSMUST00000089338 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Gm12943-201ENSMUST00000119616 210 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Gm22146-201ENSMUST00000157397 288 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 D5Ertd615e-203ENSMUST00000198493 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 AC102368.1-201ENSMUST00000227161 892 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Gm14718-201ENSMUST00000138082 752 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
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