Protein–RNA interactions for Protein: P68134

Acta1, Actin, alpha skeletal muscle, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acta1P68134 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Acta1P68134 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Acta1P68134 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Acta1P68134 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Acta1P68134 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Acta1P68134 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Acta1P68134 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Acta1P68134 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Acta1P68134 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Acta1P68134 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Acta1P68134 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Acta1P68134 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Acta1P68134 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Acta1P68134 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Acta1P68134 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Acta1P68134 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Acta1P68134 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Acta1P68134 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Acta1P68134 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Acta1P68134 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Acta1P68134 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Acta1P68134 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Acta1P68134 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Acta1P68134 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Acta1P68134 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Acta1P68134 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Acta1P68134 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Acta1P68134 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Acta1P68134 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Acta1P68134 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Acta1P68134 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Acta1P68134 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Acta1P68134 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Acta1P68134 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Acta1P68134 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Acta1P68134 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Acta1P68134 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Acta1P68134 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Acta1P68134 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Acta1P68134 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Acta1P68134 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Acta1P68134 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Acta1P68134 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Acta1P68134 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Acta1P68134 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Acta1P68134 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Acta1P68134 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Acta1P68134 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Acta1P68134 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Acta1P68134 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Acta1P68134 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Acta1P68134 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Acta1P68134 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Acta1P68134 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Acta1P68134 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Acta1P68134 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Acta1P68134 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Acta1P68134 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Acta1P68134 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Acta1P68134 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Acta1P68134 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Acta1P68134 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Acta1P68134 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Acta1P68134 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Acta1P68134 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Acta1P68134 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Acta1P68134 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Acta1P68134 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Acta1P68134 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Acta1P68134 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Acta1P68134 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Acta1P68134 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Acta1P68134 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Acta1P68134 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Acta1P68134 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Acta1P68134 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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