Protein–RNA interactions for Protein: P59708

Sf3b6, Splicing factor 3B subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b6P59708 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Sf3b6P59708 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sf3b6P59708 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sf3b6P59708 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Sf3b6P59708 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sf3b6P59708 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sf3b6P59708 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sf3b6P59708 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sf3b6P59708 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sf3b6P59708 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sf3b6P59708 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sf3b6P59708 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sf3b6P59708 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sf3b6P59708 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sf3b6P59708 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sf3b6P59708 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sf3b6P59708 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sf3b6P59708 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sf3b6P59708 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Sf3b6P59708 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sf3b6P59708 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sf3b6P59708 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sf3b6P59708 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sf3b6P59708 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sf3b6P59708 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sf3b6P59708 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sf3b6P59708 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sf3b6P59708 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sf3b6P59708 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sf3b6P59708 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sf3b6P59708 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sf3b6P59708 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sf3b6P59708 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sf3b6P59708 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sf3b6P59708 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sf3b6P59708 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sf3b6P59708 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sf3b6P59708 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sf3b6P59708 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sf3b6P59708 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sf3b6P59708 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sf3b6P59708 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sf3b6P59708 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sf3b6P59708 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sf3b6P59708 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sf3b6P59708 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Sf3b6P59708 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sf3b6P59708 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Sf3b6P59708 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sf3b6P59708 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Sf3b6P59708 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sf3b6P59708 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sf3b6P59708 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sf3b6P59708 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sf3b6P59708 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sf3b6P59708 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sf3b6P59708 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sf3b6P59708 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sf3b6P59708 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sf3b6P59708 2810454H06Rik-201ENSMUST00000189942 3148 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Sf3b6P59708 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sf3b6P59708 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sf3b6P59708 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sf3b6P59708 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sf3b6P59708 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sf3b6P59708 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sf3b6P59708 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sf3b6P59708 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Sf3b6P59708 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sf3b6P59708 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sf3b6P59708 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sf3b6P59708 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sf3b6P59708 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sf3b6P59708 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sf3b6P59708 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Sf3b6P59708 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sf3b6P59708 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sf3b6P59708 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Sf3b6P59708 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sf3b6P59708 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sf3b6P59708 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sf3b6P59708 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sf3b6P59708 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sf3b6P59708 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sf3b6P59708 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sf3b6P59708 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sf3b6P59708 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sf3b6P59708 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sf3b6P59708 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sf3b6P59708 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sf3b6P59708 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sf3b6P59708 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sf3b6P59708 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sf3b6P59708 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sf3b6P59708 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sf3b6P59708 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sf3b6P59708 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sf3b6P59708 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sf3b6P59708 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sf3b6P59708 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.9 ms