Protein–RNA interactions for Protein: P59242

Cgn, Cingulin, mousemouse

Predictions only

Length 1,191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CgnP59242 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CgnP59242 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CgnP59242 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CgnP59242 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CgnP59242 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CgnP59242 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CgnP59242 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CgnP59242 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CgnP59242 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CgnP59242 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CgnP59242 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CgnP59242 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CgnP59242 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CgnP59242 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CgnP59242 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CgnP59242 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CgnP59242 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CgnP59242 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CgnP59242 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CgnP59242 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CgnP59242 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CgnP59242 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CgnP59242 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CgnP59242 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CgnP59242 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CgnP59242 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CgnP59242 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CgnP59242 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CgnP59242 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CgnP59242 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CgnP59242 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CgnP59242 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CgnP59242 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CgnP59242 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CgnP59242 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CgnP59242 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CgnP59242 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CgnP59242 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CgnP59242 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CgnP59242 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CgnP59242 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CgnP59242 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CgnP59242 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CgnP59242 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CgnP59242 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CgnP59242 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CgnP59242 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CgnP59242 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CgnP59242 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CgnP59242 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CgnP59242 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CgnP59242 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CgnP59242 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CgnP59242 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CgnP59242 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CgnP59242 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CgnP59242 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CgnP59242 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CgnP59242 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CgnP59242 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CgnP59242 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CgnP59242 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CgnP59242 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CgnP59242 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CgnP59242 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CgnP59242 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CgnP59242 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CgnP59242 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CgnP59242 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CgnP59242 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CgnP59242 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CgnP59242 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CgnP59242 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CgnP59242 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CgnP59242 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CgnP59242 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CgnP59242 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CgnP59242 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CgnP59242 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CgnP59242 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CgnP59242 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CgnP59242 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CgnP59242 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CgnP59242 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CgnP59242 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CgnP59242 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CgnP59242 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CgnP59242 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CgnP59242 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CgnP59242 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CgnP59242 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CgnP59242 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CgnP59242 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CgnP59242 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CgnP59242 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CgnP59242 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CgnP59242 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CgnP59242 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CgnP59242 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CgnP59242 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms