Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn18P56857 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn18P56857 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn18P56857 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn18P56857 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn18P56857 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn18P56857 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn18P56857 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn18P56857 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn18P56857 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms