Protein–RNA interactions for Protein: P56213

Gfer, FAD-linked sulfhydryl oxidase ALR, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GferP56213 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
GferP56213 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
GferP56213 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
GferP56213 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
GferP56213 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
GferP56213 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
GferP56213 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
GferP56213 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
GferP56213 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
GferP56213 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
GferP56213 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
GferP56213 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
GferP56213 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
GferP56213 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
GferP56213 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
GferP56213 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
GferP56213 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
GferP56213 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
GferP56213 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
GferP56213 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
GferP56213 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
GferP56213 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
GferP56213 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
GferP56213 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
GferP56213 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
GferP56213 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
GferP56213 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
GferP56213 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
GferP56213 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
GferP56213 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
GferP56213 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
GferP56213 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
GferP56213 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
GferP56213 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
GferP56213 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
GferP56213 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
GferP56213 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
GferP56213 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
GferP56213 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
GferP56213 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
GferP56213 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
GferP56213 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
GferP56213 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
GferP56213 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
GferP56213 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
GferP56213 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
GferP56213 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
GferP56213 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
GferP56213 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
GferP56213 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
GferP56213 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
GferP56213 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
GferP56213 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
GferP56213 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
GferP56213 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
GferP56213 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
GferP56213 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
GferP56213 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
GferP56213 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
GferP56213 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
GferP56213 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
GferP56213 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
GferP56213 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
GferP56213 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
GferP56213 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
GferP56213 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
GferP56213 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
GferP56213 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
GferP56213 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
GferP56213 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
GferP56213 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
GferP56213 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
GferP56213 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
GferP56213 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
GferP56213 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
GferP56213 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
GferP56213 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
GferP56213 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
GferP56213 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
GferP56213 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
GferP56213 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.76
GferP56213 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
GferP56213 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
GferP56213 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
GferP56213 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
GferP56213 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
GferP56213 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
GferP56213 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
GferP56213 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
GferP56213 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
GferP56213 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
GferP56213 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
GferP56213 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
GferP56213 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
GferP56213 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
GferP56213 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
GferP56213 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
GferP56213 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
GferP56213 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
GferP56213 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms