Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PtpreP49446 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PtpreP49446 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PtpreP49446 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PtpreP49446 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PtpreP49446 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PtpreP49446 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
PtpreP49446 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PtpreP49446 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PtpreP49446 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PtpreP49446 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PtpreP49446 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PtpreP49446 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PtpreP49446 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PtpreP49446 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PtpreP49446 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
PtpreP49446 Gm13333-201ENSMUST00000119424 781 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
PtpreP49446 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
PtpreP49446 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
PtpreP49446 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PtpreP49446 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PtpreP49446 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
PtpreP49446 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PtpreP49446 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
PtpreP49446 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
PtpreP49446 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PtpreP49446 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PtpreP49446 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PtpreP49446 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
PtpreP49446 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PtpreP49446 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PtpreP49446 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PtpreP49446 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PtpreP49446 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PtpreP49446 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PtpreP49446 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PtpreP49446 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PtpreP49446 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PtpreP49446 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PtpreP49446 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PtpreP49446 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PtpreP49446 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PtpreP49446 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PtpreP49446 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PtpreP49446 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PtpreP49446 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PtpreP49446 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PtpreP49446 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PtpreP49446 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PtpreP49446 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PtpreP49446 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
PtpreP49446 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PtpreP49446 Gm37641-201ENSMUST00000193837 239 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
PtpreP49446 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PtpreP49446 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
PtpreP49446 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PtpreP49446 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PtpreP49446 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
PtpreP49446 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PtpreP49446 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PtpreP49446 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PtpreP49446 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PtpreP49446 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PtpreP49446 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PtpreP49446 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PtpreP49446 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PtpreP49446 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PtpreP49446 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
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PtpreP49446 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
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PtpreP49446 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PtpreP49446 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PtpreP49446 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PtpreP49446 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PtpreP49446 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PtpreP49446 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PtpreP49446 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PtpreP49446 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PtpreP49446 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PtpreP49446 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PtpreP49446 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PtpreP49446 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PtpreP49446 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PtpreP49446 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PtpreP49446 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PtpreP49446 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PtpreP49446 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PtpreP49446 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PtpreP49446 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PtpreP49446 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PtpreP49446 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
PtpreP49446 4933416E03Rik-201ENSMUST00000133091 1126 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PtpreP49446 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PtpreP49446 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PtpreP49446 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PtpreP49446 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
PtpreP49446 Gm28722-201ENSMUST00000187630 1036 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PtpreP49446 Gm28923-201ENSMUST00000187755 322 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
PtpreP49446 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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