Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SrprbP47758 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SrprbP47758 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SrprbP47758 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SrprbP47758 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SrprbP47758 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SrprbP47758 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SrprbP47758 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SrprbP47758 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SrprbP47758 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SrprbP47758 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SrprbP47758 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SrprbP47758 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SrprbP47758 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SrprbP47758 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SrprbP47758 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SrprbP47758 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SrprbP47758 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SrprbP47758 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SrprbP47758 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SrprbP47758 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
SrprbP47758 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
SrprbP47758 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SrprbP47758 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SrprbP47758 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SrprbP47758 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SrprbP47758 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SrprbP47758 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
SrprbP47758 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SrprbP47758 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SrprbP47758 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SrprbP47758 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SrprbP47758 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SrprbP47758 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SrprbP47758 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SrprbP47758 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SrprbP47758 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SrprbP47758 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SrprbP47758 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SrprbP47758 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SrprbP47758 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SrprbP47758 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SrprbP47758 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SrprbP47758 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SrprbP47758 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SrprbP47758 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SrprbP47758 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SrprbP47758 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SrprbP47758 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SrprbP47758 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SrprbP47758 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SrprbP47758 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SrprbP47758 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SrprbP47758 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SrprbP47758 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SrprbP47758 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SrprbP47758 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
SrprbP47758 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SrprbP47758 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SrprbP47758 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
SrprbP47758 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SrprbP47758 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SrprbP47758 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SrprbP47758 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SrprbP47758 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SrprbP47758 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SrprbP47758 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
SrprbP47758 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SrprbP47758 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
SrprbP47758 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
SrprbP47758 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SrprbP47758 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SrprbP47758 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
SrprbP47758 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SrprbP47758 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SrprbP47758 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SrprbP47758 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SrprbP47758 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SrprbP47758 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SrprbP47758 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SrprbP47758 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SrprbP47758 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SrprbP47758 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SrprbP47758 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SrprbP47758 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SrprbP47758 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SrprbP47758 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
SrprbP47758 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
SrprbP47758 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
SrprbP47758 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
SrprbP47758 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
SrprbP47758 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
SrprbP47758 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
SrprbP47758 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
SrprbP47758 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
SrprbP47758 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
SrprbP47758 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
SrprbP47758 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
SrprbP47758 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.12
SrprbP47758 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms