Protein–RNA interactions for Protein: P46935

Nedd4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd4P46935 Gm7541-201ENSMUST00000118361 535 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Nedd4P46935 Bach2os-202ENSMUST00000136149 687 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nedd4P46935 Gm4862-201ENSMUST00000170405 438 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Nedd4P46935 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Nedd4P46935 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nedd4P46935 1700011B04Rik-204ENSMUST00000220859 422 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nedd4P46935 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Nedd4P46935 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nedd4P46935 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nedd4P46935 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nedd4P46935 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nedd4P46935 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nedd4P46935 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nedd4P46935 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nedd4P46935 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nedd4P46935 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nedd4P46935 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nedd4P46935 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nedd4P46935 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nedd4P46935 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nedd4P46935 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nedd4P46935 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nedd4P46935 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nedd4P46935 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nedd4P46935 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nedd4P46935 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nedd4P46935 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nedd4P46935 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nedd4P46935 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nedd4P46935 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nedd4P46935 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nedd4P46935 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nedd4P46935 Gm11470-201ENSMUST00000118868 1475 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Nedd4P46935 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Nedd4P46935 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nedd4P46935 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
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Nedd4P46935 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nedd4P46935 Gm44158-201ENSMUST00000203881 505 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Nedd4P46935 Gm29797-201ENSMUST00000207856 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nedd4P46935 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nedd4P46935 Eny2-204ENSMUST00000226827 558 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nedd4P46935 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nedd4P46935 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nedd4P46935 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nedd4P46935 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nedd4P46935 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nedd4P46935 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nedd4P46935 Ube2q2-203ENSMUST00000122441 2081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nedd4P46935 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nedd4P46935 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nedd4P46935 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Nedd4P46935 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Nedd4P46935 Nat8f6-201ENSMUST00000087656 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Nedd4P46935 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nedd4P46935 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Nedd4P46935 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nedd4P46935 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nedd4P46935 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nedd4P46935 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nedd4P46935 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nedd4P46935 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nedd4P46935 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nedd4P46935 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nedd4P46935 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nedd4P46935 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nedd4P46935 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nedd4P46935 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nedd4P46935 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nedd4P46935 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nedd4P46935 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nedd4P46935 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nedd4P46935 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nedd4P46935 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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