Protein–RNA interactions for Protein: P43406

Itgav, Integrin alpha-V, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgavP43406 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ItgavP43406 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ItgavP43406 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
ItgavP43406 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ItgavP43406 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ItgavP43406 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ItgavP43406 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.7 ms