Protein–RNA interactions for Protein: P35278

Rab5c, Ras-related protein Rab-5C, mousemouse

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5cP35278 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Thbs2-201ENSMUST00000170872 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Chic1-201ENSMUST00000116547 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Loxhd1-202ENSMUST00000096547 6595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Maob-201ENSMUST00000040820 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
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Rab5cP35278 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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Rab5cP35278 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
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Rab5cP35278 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
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Rab5cP35278 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Ntrk3-205ENSMUST00000193002 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Rdh11-201ENSMUST00000085254 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Ciita-201ENSMUST00000023147 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Ccdc63-201ENSMUST00000058960 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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