Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

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Length 304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxc11P31313 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxc11P31313 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxc11P31313 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxc11P31313 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxc11P31313 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxc11P31313 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxc11P31313 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxc11P31313 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxc11P31313 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxc11P31313 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxc11P31313 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxc11P31313 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxc11P31313 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxc11P31313 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxc11P31313 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxc11P31313 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxc11P31313 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxc11P31313 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxc11P31313 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxc11P31313 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxc11P31313 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxc11P31313 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxc11P31313 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxc11P31313 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxc11P31313 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxc11P31313 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxc11P31313 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxc11P31313 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxc11P31313 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxc11P31313 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxc11P31313 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxc11P31313 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxc11P31313 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxc11P31313 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxc11P31313 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxc11P31313 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxc11P31313 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxc11P31313 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxc11P31313 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxc11P31313 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxc11P31313 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxc11P31313 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxc11P31313 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxc11P31313 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxc11P31313 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxc11P31313 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxc11P31313 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxc11P31313 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxc11P31313 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxc11P31313 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxc11P31313 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxc11P31313 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxc11P31313 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxc11P31313 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxc11P31313 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxc11P31313 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxc11P31313 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxc11P31313 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxc11P31313 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxc11P31313 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxc11P31313 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxc11P31313 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
Hoxc11P31313 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
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Hoxc11P31313 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxc11P31313 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxc11P31313 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Hoxc11P31313 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxc11P31313 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxc11P31313 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxc11P31313 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxc11P31313 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxc11P31313 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxc11P31313 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxc11P31313 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxc11P31313 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxc11P31313 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxc11P31313 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxc11P31313 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxc11P31313 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxc11P31313 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxc11P31313 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxc11P31313 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxc11P31313 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxc11P31313 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxc11P31313 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxc11P31313 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxc11P31313 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxc11P31313 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxc11P31313 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxc11P31313 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxc11P31313 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxc11P31313 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxc11P31313 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxc11P31313 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxc11P31313 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxc11P31313 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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