Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxd10P28359 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxd10P28359 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxd10P28359 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxd10P28359 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxd10P28359 Gm12816-201ENSMUST00000118069 1212 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxd10P28359 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxd10P28359 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxd10P28359 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxd10P28359 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxd10P28359 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxd10P28359 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxd10P28359 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxd10P28359 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxd10P28359 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxd10P28359 2310074N15Rik-201ENSMUST00000198276 582 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
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Hoxd10P28359 1700012D14Rik-204ENSMUST00000210788 547 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxd10P28359 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxd10P28359 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxd10P28359 Srp19-201ENSMUST00000072576 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxd10P28359 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxd10P28359 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxd10P28359 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxd10P28359 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxd10P28359 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxd10P28359 E330023G01Rik-201ENSMUST00000186387 1483 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Hoxd10P28359 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxd10P28359 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxd10P28359 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxd10P28359 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxd10P28359 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxd10P28359 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Hoxd10P28359 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Hoxd10P28359 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Hoxd10P28359 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Hoxd10P28359 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxd10P28359 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxd10P28359 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxd10P28359 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Hoxd10P28359 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Hoxd10P28359 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxd10P28359 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxd10P28359 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxd10P28359 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxd10P28359 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Hoxd10P28359 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxd10P28359 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxd10P28359 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxd10P28359 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxd10P28359 Gm17877-201ENSMUST00000192578 814 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
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Hoxd10P28359 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxd10P28359 1700012P22Rik-201ENSMUST00000030323 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxd10P28359 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxd10P28359 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxd10P28359 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxd10P28359 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxd10P28359 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxd10P28359 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxd10P28359 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hoxd10P28359 Gm7278-201ENSMUST00000119836 1401 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
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Hoxd10P28359 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hoxd10P28359 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hoxd10P28359 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hoxd10P28359 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hoxd10P28359 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hoxd10P28359 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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