Protein–RNA interactions for Protein: P27641

Xrcc5, X-ray repair cross-complementing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 732 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc5P27641 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Xrcc5P27641 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Xrcc5P27641 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Xrcc5P27641 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Xrcc5P27641 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Xrcc5P27641 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Xrcc5P27641 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Xrcc5P27641 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Xrcc5P27641 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Xrcc5P27641 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Xrcc5P27641 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Xrcc5P27641 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Xrcc5P27641 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Xrcc5P27641 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Xrcc5P27641 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
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Xrcc5P27641 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Xrcc5P27641 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Xrcc5P27641 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Xrcc5P27641 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Xrcc5P27641 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Xrcc5P27641 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Xrcc5P27641 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Xrcc5P27641 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Xrcc5P27641 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Xrcc5P27641 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Xrcc5P27641 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Xrcc5P27641 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Xrcc5P27641 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Xrcc5P27641 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Xrcc5P27641 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Xrcc5P27641 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Xrcc5P27641 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Xrcc5P27641 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Xrcc5P27641 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Xrcc5P27641 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Xrcc5P27641 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Xrcc5P27641 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Xrcc5P27641 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Xrcc5P27641 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Xrcc5P27641 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Xrcc5P27641 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Xrcc5P27641 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Xrcc5P27641 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Xrcc5P27641 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Xrcc5P27641 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Xrcc5P27641 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Xrcc5P27641 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Xrcc5P27641 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Xrcc5P27641 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Xrcc5P27641 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Xrcc5P27641 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Xrcc5P27641 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Xrcc5P27641 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Xrcc5P27641 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Xrcc5P27641 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Xrcc5P27641 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Xrcc5P27641 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Xrcc5P27641 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Xrcc5P27641 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Xrcc5P27641 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Xrcc5P27641 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Xrcc5P27641 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Xrcc5P27641 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Xrcc5P27641 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Xrcc5P27641 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Xrcc5P27641 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Xrcc5P27641 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Xrcc5P27641 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Xrcc5P27641 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Xrcc5P27641 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Xrcc5P27641 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Xrcc5P27641 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Xrcc5P27641 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Xrcc5P27641 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Xrcc5P27641 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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