Protein–RNA interactions for Protein: P18525

Ig heavy chain V region 5-84, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18525 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P18525 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P18525 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P18525 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P18525 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P18525 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P18525 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P18525 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P18525 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P18525 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P18525 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P18525 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P18525 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P18525 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P18525 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P18525 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P18525 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P18525 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P18525 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P18525 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P18525 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P18525 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P18525 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P18525 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P18525 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P18525 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P18525 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P18525 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P18525 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P18525 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P18525 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P18525 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P18525 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P18525 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
P18525 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P18525 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P18525 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P18525 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P18525 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P18525 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P18525 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P18525 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P18525 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P18525 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P18525 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P18525 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
P18525 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
P18525 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
P18525 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P18525 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P18525 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P18525 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P18525 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P18525 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P18525 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P18525 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P18525 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P18525 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P18525 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P18525 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P18525 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P18525 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P18525 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P18525 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P18525 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
P18525 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P18525 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P18525 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P18525 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P18525 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P18525 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P18525 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P18525 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P18525 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P18525 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P18525 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P18525 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P18525 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P18525 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P18525 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P18525 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P18525 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P18525 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P18525 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P18525 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P18525 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
P18525 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P18525 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P18525 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P18525 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P18525 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
P18525 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P18525 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
P18525 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P18525 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P18525 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P18525 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
P18525 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
P18525 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P18525 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
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