Protein–RNA interactions for Protein: P17433

Spi1, Transcription factor PU.1, mousemouse

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Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spi1P17433 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Spi1P17433 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Spi1P17433 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Spi1P17433 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Spi1P17433 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Spi1P17433 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Spi1P17433 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Spi1P17433 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Spi1P17433 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Spi1P17433 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Spi1P17433 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Spi1P17433 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Spi1P17433 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Spi1P17433 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Spi1P17433 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Spi1P17433 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Spi1P17433 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Spi1P17433 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Spi1P17433 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Spi1P17433 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Spi1P17433 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Spi1P17433 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Spi1P17433 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Spi1P17433 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Spi1P17433 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Spi1P17433 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Spi1P17433 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Spi1P17433 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Spi1P17433 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Spi1P17433 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Spi1P17433 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Spi1P17433 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Spi1P17433 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Spi1P17433 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Spi1P17433 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Spi1P17433 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Spi1P17433 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Spi1P17433 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Spi1P17433 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Spi1P17433 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Spi1P17433 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Spi1P17433 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Spi1P17433 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Spi1P17433 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Spi1P17433 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Spi1P17433 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Spi1P17433 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Spi1P17433 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Spi1P17433 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Spi1P17433 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Spi1P17433 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Spi1P17433 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Spi1P17433 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Spi1P17433 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Spi1P17433 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Spi1P17433 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Spi1P17433 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Spi1P17433 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Spi1P17433 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Spi1P17433 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Spi1P17433 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Spi1P17433 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Spi1P17433 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Spi1P17433 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Spi1P17433 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Spi1P17433 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Spi1P17433 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Spi1P17433 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Spi1P17433 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Spi1P17433 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Spi1P17433 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Spi1P17433 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Spi1P17433 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Spi1P17433 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Spi1P17433 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Spi1P17433 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Spi1P17433 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Spi1P17433 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Spi1P17433 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Spi1P17433 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Spi1P17433 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Spi1P17433 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Spi1P17433 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Spi1P17433 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Spi1P17433 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Spi1P17433 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Spi1P17433 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Spi1P17433 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Spi1P17433 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Spi1P17433 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Spi1P17433 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Spi1P17433 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Spi1P17433 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Spi1P17433 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Spi1P17433 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Spi1P17433 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Spi1P17433 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Spi1P17433 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Spi1P17433 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Spi1P17433 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms