Protein–RNA interactions for Protein: P17208

Pou4f1, POU domain, class 4, transcription factor 1, mousemouse

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Length 421 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f1P17208 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pou4f1P17208 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pou4f1P17208 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pou4f1P17208 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pou4f1P17208 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pou4f1P17208 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pou4f1P17208 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pou4f1P17208 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pou4f1P17208 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pou4f1P17208 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Pou4f1P17208 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Pou4f1P17208 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pou4f1P17208 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Pou4f1P17208 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pou4f1P17208 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pou4f1P17208 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pou4f1P17208 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pou4f1P17208 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Pou4f1P17208 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pou4f1P17208 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pou4f1P17208 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pou4f1P17208 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pou4f1P17208 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pou4f1P17208 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pou4f1P17208 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pou4f1P17208 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pou4f1P17208 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pou4f1P17208 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pou4f1P17208 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pou4f1P17208 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pou4f1P17208 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pou4f1P17208 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pou4f1P17208 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pou4f1P17208 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pou4f1P17208 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pou4f1P17208 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pou4f1P17208 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pou4f1P17208 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pou4f1P17208 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pou4f1P17208 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pou4f1P17208 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pou4f1P17208 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pou4f1P17208 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pou4f1P17208 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pou4f1P17208 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pou4f1P17208 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pou4f1P17208 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Pou4f1P17208 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pou4f1P17208 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Pou4f1P17208 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Pou4f1P17208 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Pou4f1P17208 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pou4f1P17208 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pou4f1P17208 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pou4f1P17208 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Pou4f1P17208 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pou4f1P17208 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pou4f1P17208 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Pou4f1P17208 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Pou4f1P17208 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pou4f1P17208 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Pou4f1P17208 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pou4f1P17208 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pou4f1P17208 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pou4f1P17208 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pou4f1P17208 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pou4f1P17208 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pou4f1P17208 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pou4f1P17208 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pou4f1P17208 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pou4f1P17208 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pou4f1P17208 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pou4f1P17208 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Pou4f1P17208 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Pou4f1P17208 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Pou4f1P17208 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Pou4f1P17208 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Pou4f1P17208 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Pou4f1P17208 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Pou4f1P17208 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Pou4f1P17208 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pou4f1P17208 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pou4f1P17208 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pou4f1P17208 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pou4f1P17208 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pou4f1P17208 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pou4f1P17208 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pou4f1P17208 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pou4f1P17208 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Pou4f1P17208 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pou4f1P17208 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pou4f1P17208 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pou4f1P17208 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pou4f1P17208 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pou4f1P17208 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pou4f1P17208 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Pou4f1P17208 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pou4f1P17208 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pou4f1P17208 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pou4f1P17208 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms