Protein–RNA interactions for Protein: P15620

Znf271, Zinc finger protein 271, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf271P15620 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Znf271P15620 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Znf271P15620 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Znf271P15620 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Znf271P15620 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Znf271P15620 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Znf271P15620 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Znf271P15620 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Znf271P15620 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Znf271P15620 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Znf271P15620 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Znf271P15620 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Znf271P15620 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Znf271P15620 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Znf271P15620 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Znf271P15620 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Znf271P15620 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Znf271P15620 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Znf271P15620 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Znf271P15620 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Znf271P15620 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Znf271P15620 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Znf271P15620 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Znf271P15620 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Znf271P15620 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Znf271P15620 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Znf271P15620 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Znf271P15620 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Znf271P15620 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Znf271P15620 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Znf271P15620 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Znf271P15620 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Znf271P15620 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Znf271P15620 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Znf271P15620 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Znf271P15620 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Znf271P15620 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Znf271P15620 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Znf271P15620 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Znf271P15620 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Znf271P15620 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Znf271P15620 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Znf271P15620 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Znf271P15620 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Znf271P15620 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Znf271P15620 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Znf271P15620 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Znf271P15620 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Znf271P15620 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Znf271P15620 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Znf271P15620 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Znf271P15620 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Znf271P15620 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Znf271P15620 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Znf271P15620 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Znf271P15620 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Znf271P15620 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Znf271P15620 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Znf271P15620 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Znf271P15620 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Znf271P15620 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Znf271P15620 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Znf271P15620 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Znf271P15620 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Znf271P15620 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Znf271P15620 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Znf271P15620 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Znf271P15620 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Znf271P15620 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Znf271P15620 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Znf271P15620 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Znf271P15620 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Znf271P15620 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Znf271P15620 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Znf271P15620 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Znf271P15620 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Znf271P15620 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Znf271P15620 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Znf271P15620 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Znf271P15620 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Znf271P15620 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Znf271P15620 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Znf271P15620 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Znf271P15620 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Znf271P15620 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Znf271P15620 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Znf271P15620 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Znf271P15620 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Znf271P15620 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Znf271P15620 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Znf271P15620 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Znf271P15620 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Znf271P15620 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Znf271P15620 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Znf271P15620 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Znf271P15620 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Znf271P15620 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Znf271P15620 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Znf271P15620 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Znf271P15620 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms