Protein–RNA interactions for Protein: P07350

Ifna6, Interferon alpha-6, mousemouse

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Length 189 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna6P07350 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ifna6P07350 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ifna6P07350 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ifna6P07350 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ifna6P07350 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ifna6P07350 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ifna6P07350 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ifna6P07350 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ifna6P07350 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ifna6P07350 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ifna6P07350 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ifna6P07350 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ifna6P07350 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ifna6P07350 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ifna6P07350 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ifna6P07350 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ifna6P07350 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ifna6P07350 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ifna6P07350 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ifna6P07350 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ifna6P07350 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ifna6P07350 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ifna6P07350 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ifna6P07350 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ifna6P07350 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ifna6P07350 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ifna6P07350 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ifna6P07350 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ifna6P07350 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ifna6P07350 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ifna6P07350 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ifna6P07350 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ifna6P07350 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ifna6P07350 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ifna6P07350 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ifna6P07350 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ifna6P07350 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ifna6P07350 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ifna6P07350 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ifna6P07350 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ifna6P07350 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ifna6P07350 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ifna6P07350 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ifna6P07350 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ifna6P07350 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ifna6P07350 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ifna6P07350 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ifna6P07350 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ifna6P07350 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ifna6P07350 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ifna6P07350 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ifna6P07350 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ifna6P07350 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ifna6P07350 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ifna6P07350 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ifna6P07350 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ifna6P07350 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ifna6P07350 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ifna6P07350 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ifna6P07350 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ifna6P07350 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ifna6P07350 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ifna6P07350 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ifna6P07350 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ifna6P07350 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ifna6P07350 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ifna6P07350 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ifna6P07350 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ifna6P07350 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ifna6P07350 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ifna6P07350 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ifna6P07350 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ifna6P07350 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ifna6P07350 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ifna6P07350 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ifna6P07350 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ifna6P07350 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ifna6P07350 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ifna6P07350 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ifna6P07350 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Ifna6P07350 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ifna6P07350 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ifna6P07350 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ifna6P07350 Tardbp-206ENSMUST00000105702 6425 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ifna6P07350 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ifna6P07350 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ifna6P07350 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ifna6P07350 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ifna6P07350 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ifna6P07350 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Ifna6P07350 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ifna6P07350 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ifna6P07350 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ifna6P07350 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ifna6P07350 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ifna6P07350 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ifna6P07350 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ifna6P07350 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ifna6P07350 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ifna6P07350 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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