Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
H2-Eb1P04230 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
H2-Eb1P04230 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
H2-Eb1P04230 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
H2-Eb1P04230 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
H2-Eb1P04230 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
H2-Eb1P04230 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
H2-Eb1P04230 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
H2-Eb1P04230 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
H2-Eb1P04230 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
H2-Eb1P04230 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
H2-Eb1P04230 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
H2-Eb1P04230 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
H2-Eb1P04230 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
H2-Eb1P04230 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
H2-Eb1P04230 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
H2-Eb1P04230 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
H2-Eb1P04230 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
H2-Eb1P04230 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
H2-Eb1P04230 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
H2-Eb1P04230 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
H2-Eb1P04230 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
H2-Eb1P04230 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
H2-Eb1P04230 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
H2-Eb1P04230 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
H2-Eb1P04230 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
H2-Eb1P04230 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
H2-Eb1P04230 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
H2-Eb1P04230 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
H2-Eb1P04230 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
H2-Eb1P04230 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
H2-Eb1P04230 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
H2-Eb1P04230 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
H2-Eb1P04230 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
H2-Eb1P04230 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
H2-Eb1P04230 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
H2-Eb1P04230 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
H2-Eb1P04230 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
H2-Eb1P04230 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
H2-Eb1P04230 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
H2-Eb1P04230 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
H2-Eb1P04230 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
H2-Eb1P04230 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
H2-Eb1P04230 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
H2-Eb1P04230 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
H2-Eb1P04230 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
H2-Eb1P04230 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
H2-Eb1P04230 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
H2-Eb1P04230 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
H2-Eb1P04230 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
H2-Eb1P04230 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
H2-Eb1P04230 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
H2-Eb1P04230 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
H2-Eb1P04230 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
H2-Eb1P04230 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
H2-Eb1P04230 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
H2-Eb1P04230 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
H2-Eb1P04230 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
H2-Eb1P04230 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
H2-Eb1P04230 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
H2-Eb1P04230 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
H2-Eb1P04230 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
H2-Eb1P04230 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
H2-Eb1P04230 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
H2-Eb1P04230 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
H2-Eb1P04230 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
H2-Eb1P04230 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
H2-Eb1P04230 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
H2-Eb1P04230 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
H2-Eb1P04230 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
H2-Eb1P04230 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
H2-Eb1P04230 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
H2-Eb1P04230 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
H2-Eb1P04230 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
H2-Eb1P04230 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
H2-Eb1P04230 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
H2-Eb1P04230 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
H2-Eb1P04230 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
H2-Eb1P04230 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
H2-Eb1P04230 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
H2-Eb1P04230 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
H2-Eb1P04230 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
H2-Eb1P04230 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
H2-Eb1P04230 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
H2-Eb1P04230 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
H2-Eb1P04230 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
H2-Eb1P04230 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
H2-Eb1P04230 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
H2-Eb1P04230 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
H2-Eb1P04230 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
H2-Eb1P04230 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
H2-Eb1P04230 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
H2-Eb1P04230 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
H2-Eb1P04230 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
H2-Eb1P04230 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
H2-Eb1P04230 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
H2-Eb1P04230 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
H2-Eb1P04230 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
H2-Eb1P04230 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
H2-Eb1P04230 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms