Protein–RNA interactions for Protein: P01649

Ig kappa chain V-V regions, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01649 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
P01649 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
P01649 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P01649 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
P01649 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P01649 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
P01649 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P01649 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P01649 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
P01649 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P01649 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P01649 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P01649 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P01649 Gm12439-201ENSMUST00000117162 365 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
P01649 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
P01649 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
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P01649 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
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P01649 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
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P01649 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
P01649 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P01649 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
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P01649 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
P01649 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P01649 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P01649 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P01649 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P01649 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P01649 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P01649 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P01649 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P01649 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P01649 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
P01649 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
P01649 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.74
P01649 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P01649 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P01649 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P01649 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
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P01649 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
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P01649 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01649 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01649 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01649 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01649 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
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P01649 C130071C03Rik-203ENSMUST00000182788 1368 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01649 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
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P01649 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01649 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
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P01649 1700041M19Rik-202ENSMUST00000190908 1123 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
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P01649 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01649 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
P01649 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01649 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01649 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01649 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01649 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01649 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01649 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01649 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01649 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01649 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01649 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01649 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01649 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01649 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01649 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01649 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01649 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01649 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01649 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01649 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01649 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01649 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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