Protein–RNA interactions for Protein: O55082

Ptpn20, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 20, mousemouse

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Length 426 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn20O55082 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ptpn20O55082 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ptpn20O55082 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Ptpn20O55082 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ptpn20O55082 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ptpn20O55082 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ptpn20O55082 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ptpn20O55082 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ptpn20O55082 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ptpn20O55082 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ptpn20O55082 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ptpn20O55082 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ptpn20O55082 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ptpn20O55082 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ptpn20O55082 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ptpn20O55082 Gm40617-201ENSMUST00000218840 2420 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ptpn20O55082 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ptpn20O55082 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ptpn20O55082 Crybg3-205ENSMUST00000172910 2870 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ptpn20O55082 Gm10463-202ENSMUST00000195772 2889 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Ptpn20O55082 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ptpn20O55082 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ptpn20O55082 Plcd4-205ENSMUST00000113749 4648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ptpn20O55082 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ptpn20O55082 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ptpn20O55082 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ptpn20O55082 Nap1l2-201ENSMUST00000121720 2465 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ptpn20O55082 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ptpn20O55082 Plscr3-203ENSMUST00000108633 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ptpn20O55082 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ptpn20O55082 Smpd4-219ENSMUST00000170366 2256 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ptpn20O55082 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ptpn20O55082 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ptpn20O55082 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ptpn20O55082 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ptpn20O55082 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ptpn20O55082 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ptpn20O55082 Uba1-201ENSMUST00000001989 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ptpn20O55082 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ptpn20O55082 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ptpn20O55082 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ptpn20O55082 Zfp956-201ENSMUST00000101445 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ptpn20O55082 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ptpn20O55082 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Ptpn20O55082 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ptpn20O55082 Dhx40-201ENSMUST00000018569 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ptpn20O55082 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ptpn20O55082 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Ptpn20O55082 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Ptpn20O55082 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Ptpn20O55082 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Ptpn20O55082 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ptpn20O55082 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ptpn20O55082 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ptpn20O55082 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ptpn20O55082 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ptpn20O55082 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ptpn20O55082 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ptpn20O55082 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ptpn20O55082 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ptpn20O55082 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ptpn20O55082 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ptpn20O55082 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ptpn20O55082 Kcnab2-207ENSMUST00000160884 3922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ptpn20O55082 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ptpn20O55082 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ptpn20O55082 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ptpn20O55082 Slc6a9-202ENSMUST00000063857 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ptpn20O55082 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ptpn20O55082 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ptpn20O55082 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ptpn20O55082 Agpat3-204ENSMUST00000105389 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ptpn20O55082 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ptpn20O55082 Nek4-207ENSMUST00000228328 4245 ntAPPRIS P2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ptpn20O55082 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ptpn20O55082 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ptpn20O55082 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ptpn20O55082 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ptpn20O55082 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ptpn20O55082 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ptpn20O55082 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ptpn20O55082 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ptpn20O55082 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ptpn20O55082 Pabpc4-201ENSMUST00000078734 2700 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ptpn20O55082 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ptpn20O55082 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ptpn20O55082 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ptpn20O55082 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ptpn20O55082 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ptpn20O55082 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ptpn20O55082 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ptpn20O55082 Prpf6-203ENSMUST00000136481 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ptpn20O55082 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ptpn20O55082 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ptpn20O55082 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ptpn20O55082 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ptpn20O55082 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ptpn20O55082 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ptpn20O55082 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ptpn20O55082 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 329 ms