Protein–RNA interactions for Protein: O54909

Rdh16, Cis-retinol androgen dehydrogenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh16O54909 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rdh16O54909 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rdh16O54909 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rdh16O54909 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rdh16O54909 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rdh16O54909 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rdh16O54909 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rdh16O54909 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rdh16O54909 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rdh16O54909 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rdh16O54909 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rdh16O54909 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rdh16O54909 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rdh16O54909 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Rdh16O54909 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rdh16O54909 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rdh16O54909 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rdh16O54909 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Rdh16O54909 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Rdh16O54909 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Rdh16O54909 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Rdh16O54909 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
Rdh16O54909 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Rdh16O54909 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Rdh16O54909 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Rdh16O54909 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Rdh16O54909 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Rdh16O54909 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Rdh16O54909 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rdh16O54909 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rdh16O54909 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rdh16O54909 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rdh16O54909 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rdh16O54909 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rdh16O54909 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Rdh16O54909 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rdh16O54909 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Rdh16O54909 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Rdh16O54909 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Rdh16O54909 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rdh16O54909 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rdh16O54909 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rdh16O54909 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rdh16O54909 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rdh16O54909 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rdh16O54909 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rdh16O54909 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rdh16O54909 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Rdh16O54909 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Rdh16O54909 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Rdh16O54909 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rdh16O54909 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rdh16O54909 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rdh16O54909 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rdh16O54909 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Rdh16O54909 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Rdh16O54909 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Rdh16O54909 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rdh16O54909 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Rdh16O54909 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rdh16O54909 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rdh16O54909 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rdh16O54909 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rdh16O54909 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rdh16O54909 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rdh16O54909 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rdh16O54909 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rdh16O54909 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rdh16O54909 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rdh16O54909 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rdh16O54909 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rdh16O54909 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rdh16O54909 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rdh16O54909 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rdh16O54909 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rdh16O54909 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rdh16O54909 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rdh16O54909 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rdh16O54909 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rdh16O54909 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rdh16O54909 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rdh16O54909 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rdh16O54909 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rdh16O54909 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rdh16O54909 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rdh16O54909 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rdh16O54909 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rdh16O54909 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rdh16O54909 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rdh16O54909 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rdh16O54909 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rdh16O54909 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rdh16O54909 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rdh16O54909 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Rdh16O54909 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rdh16O54909 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rdh16O54909 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rdh16O54909 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Rdh16O54909 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rdh16O54909 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.2 ms