Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
DffaO54786 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
DffaO54786 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
DffaO54786 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
DffaO54786 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
DffaO54786 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
DffaO54786 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
DffaO54786 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
DffaO54786 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
DffaO54786 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
DffaO54786 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
DffaO54786 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
DffaO54786 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
DffaO54786 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
DffaO54786 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
DffaO54786 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
DffaO54786 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
DffaO54786 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
DffaO54786 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
DffaO54786 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
DffaO54786 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
DffaO54786 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
DffaO54786 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
DffaO54786 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
DffaO54786 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
DffaO54786 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
DffaO54786 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
DffaO54786 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
DffaO54786 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
DffaO54786 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
DffaO54786 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
DffaO54786 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
DffaO54786 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
DffaO54786 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
DffaO54786 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
DffaO54786 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
DffaO54786 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
DffaO54786 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
DffaO54786 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
DffaO54786 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
DffaO54786 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
DffaO54786 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
DffaO54786 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
DffaO54786 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
DffaO54786 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
DffaO54786 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
DffaO54786 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
DffaO54786 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
DffaO54786 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
DffaO54786 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
DffaO54786 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
DffaO54786 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
DffaO54786 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
DffaO54786 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
DffaO54786 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
DffaO54786 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
DffaO54786 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
DffaO54786 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
DffaO54786 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
DffaO54786 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
DffaO54786 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
DffaO54786 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
DffaO54786 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
DffaO54786 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
DffaO54786 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
DffaO54786 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
DffaO54786 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
DffaO54786 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
DffaO54786 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
DffaO54786 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
DffaO54786 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
DffaO54786 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
DffaO54786 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
DffaO54786 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
DffaO54786 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
DffaO54786 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
DffaO54786 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
DffaO54786 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
DffaO54786 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
DffaO54786 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DffaO54786 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DffaO54786 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DffaO54786 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DffaO54786 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DffaO54786 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DffaO54786 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DffaO54786 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
DffaO54786 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DffaO54786 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DffaO54786 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DffaO54786 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DffaO54786 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DffaO54786 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC13□□□□□ -0.33
DffaO54786 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
DffaO54786 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DffaO54786 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DffaO54786 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
DffaO54786 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DffaO54786 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DffaO54786 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.1 ms