Protein–RNA interactions for Protein: O35601

Fyb1, FYN-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 819 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fyb1O35601 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fyb1O35601 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fyb1O35601 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fyb1O35601 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fyb1O35601 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Fyb1O35601 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fyb1O35601 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fyb1O35601 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fyb1O35601 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Fyb1O35601 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fyb1O35601 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fyb1O35601 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fyb1O35601 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fyb1O35601 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fyb1O35601 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fyb1O35601 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Fyb1O35601 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Fyb1O35601 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Fyb1O35601 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Fyb1O35601 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fyb1O35601 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fyb1O35601 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fyb1O35601 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fyb1O35601 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fyb1O35601 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fyb1O35601 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fyb1O35601 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fyb1O35601 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fyb1O35601 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fyb1O35601 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Fyb1O35601 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fyb1O35601 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fyb1O35601 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fyb1O35601 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fyb1O35601 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fyb1O35601 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fyb1O35601 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fyb1O35601 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Fyb1O35601 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fyb1O35601 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fyb1O35601 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fyb1O35601 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fyb1O35601 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Fyb1O35601 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Fyb1O35601 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fyb1O35601 AC136986.1-201ENSMUST00000222829 380 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fyb1O35601 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fyb1O35601 Krtap19-9b-201ENSMUST00000077715 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fyb1O35601 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fyb1O35601 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fyb1O35601 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fyb1O35601 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fyb1O35601 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fyb1O35601 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fyb1O35601 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fyb1O35601 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fyb1O35601 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fyb1O35601 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fyb1O35601 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fyb1O35601 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fyb1O35601 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fyb1O35601 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Fyb1O35601 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fyb1O35601 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fyb1O35601 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fyb1O35601 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fyb1O35601 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fyb1O35601 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fyb1O35601 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fyb1O35601 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fyb1O35601 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fyb1O35601 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fyb1O35601 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fyb1O35601 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fyb1O35601 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fyb1O35601 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fyb1O35601 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fyb1O35601 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fyb1O35601 Trpm2-201ENSMUST00000105399 731 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fyb1O35601 Ccdc163-204ENSMUST00000106464 1213 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fyb1O35601 Olfr269-ps1-201ENSMUST00000120783 302 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Fyb1O35601 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fyb1O35601 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Fyb1O35601 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fyb1O35601 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fyb1O35601 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Fyb1O35601 Gm8492-201ENSMUST00000182375 987 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Fyb1O35601 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fyb1O35601 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fyb1O35601 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fyb1O35601 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fyb1O35601 Asna1-201ENSMUST00000064314 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fyb1O35601 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fyb1O35601 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fyb1O35601 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fyb1O35601 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fyb1O35601 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fyb1O35601 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fyb1O35601 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fyb1O35601 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms