Protein–RNA interactions for Protein: O35491

Clk2, Dual specificity protein kinase CLK2, mousemouse

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Length 499 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk2O35491 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Clk2O35491 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Clk2O35491 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Clk2O35491 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Clk2O35491 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Clk2O35491 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Clk2O35491 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Clk2O35491 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Clk2O35491 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Clk2O35491 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Clk2O35491 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Clk2O35491 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Clk2O35491 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Clk2O35491 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Clk2O35491 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Clk2O35491 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Clk2O35491 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Clk2O35491 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Clk2O35491 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Clk2O35491 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Clk2O35491 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Clk2O35491 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Clk2O35491 Gm37648-201ENSMUST00000192072 2563 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Clk2O35491 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Clk2O35491 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Clk2O35491 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Clk2O35491 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Clk2O35491 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Clk2O35491 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Clk2O35491 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Clk2O35491 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Clk2O35491 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Clk2O35491 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Clk2O35491 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Clk2O35491 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Clk2O35491 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Clk2O35491 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Clk2O35491 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Clk2O35491 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Clk2O35491 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Clk2O35491 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Clk2O35491 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Clk2O35491 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Clk2O35491 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Clk2O35491 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Clk2O35491 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Clk2O35491 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Clk2O35491 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Clk2O35491 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Clk2O35491 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Clk2O35491 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Clk2O35491 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Clk2O35491 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Clk2O35491 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Clk2O35491 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Clk2O35491 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Clk2O35491 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Clk2O35491 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Clk2O35491 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Clk2O35491 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Clk2O35491 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Clk2O35491 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Clk2O35491 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Clk2O35491 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Clk2O35491 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Clk2O35491 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Clk2O35491 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Clk2O35491 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Clk2O35491 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Clk2O35491 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Clk2O35491 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Clk2O35491 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Clk2O35491 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Clk2O35491 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Clk2O35491 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Clk2O35491 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Clk2O35491 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Clk2O35491 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Clk2O35491 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Clk2O35491 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Clk2O35491 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Clk2O35491 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Clk2O35491 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Clk2O35491 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Clk2O35491 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Clk2O35491 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Clk2O35491 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Clk2O35491 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Clk2O35491 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Clk2O35491 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Clk2O35491 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Clk2O35491 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Clk2O35491 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Clk2O35491 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Clk2O35491 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Clk2O35491 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Clk2O35491 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Clk2O35491 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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