Protein–RNA interactions for Protein: O08545

Efna3, Ephrin-A3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna3O08545 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Efna3O08545 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Efna3O08545 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Efna3O08545 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Efna3O08545 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Efna3O08545 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Efna3O08545 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Efna3O08545 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Efna3O08545 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Efna3O08545 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Efna3O08545 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Efna3O08545 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Efna3O08545 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Efna3O08545 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Efna3O08545 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Efna3O08545 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Efna3O08545 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Efna3O08545 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Efna3O08545 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Efna3O08545 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Efna3O08545 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Efna3O08545 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Efna3O08545 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Efna3O08545 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Efna3O08545 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Efna3O08545 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Efna3O08545 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Efna3O08545 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Efna3O08545 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Efna3O08545 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Efna3O08545 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Efna3O08545 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Efna3O08545 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Efna3O08545 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Efna3O08545 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Efna3O08545 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Efna3O08545 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Efna3O08545 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.6 ms