Protein–RNA interactions for Protein: O08540

Msmb, Beta-microseminoprotein, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsmbO08540 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
MsmbO08540 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
MsmbO08540 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
MsmbO08540 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
MsmbO08540 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
MsmbO08540 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
MsmbO08540 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
MsmbO08540 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
MsmbO08540 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
MsmbO08540 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
MsmbO08540 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
MsmbO08540 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
MsmbO08540 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
MsmbO08540 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
MsmbO08540 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
MsmbO08540 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
MsmbO08540 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
MsmbO08540 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
MsmbO08540 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
MsmbO08540 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
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MsmbO08540 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
MsmbO08540 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
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MsmbO08540 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
MsmbO08540 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
MsmbO08540 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.88
MsmbO08540 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
MsmbO08540 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
MsmbO08540 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
MsmbO08540 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
MsmbO08540 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
MsmbO08540 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
MsmbO08540 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
MsmbO08540 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
MsmbO08540 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
MsmbO08540 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
MsmbO08540 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
MsmbO08540 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
MsmbO08540 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
MsmbO08540 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
MsmbO08540 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
MsmbO08540 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
MsmbO08540 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
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MsmbO08540 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
MsmbO08540 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
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MsmbO08540 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
MsmbO08540 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
MsmbO08540 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
MsmbO08540 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
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MsmbO08540 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
MsmbO08540 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
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MsmbO08540 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
MsmbO08540 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
MsmbO08540 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
MsmbO08540 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
MsmbO08540 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
MsmbO08540 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
MsmbO08540 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
MsmbO08540 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
MsmbO08540 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
MsmbO08540 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
MsmbO08540 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
MsmbO08540 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
MsmbO08540 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
MsmbO08540 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
MsmbO08540 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
MsmbO08540 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
MsmbO08540 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
MsmbO08540 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
MsmbO08540 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
MsmbO08540 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
MsmbO08540 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
MsmbO08540 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
MsmbO08540 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
MsmbO08540 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
MsmbO08540 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
MsmbO08540 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
MsmbO08540 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
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