Protein–RNA interactions for Protein: J3QM67

Gm20825, Predicted gene, 20825, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20825J3QM67 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm20825J3QM67 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm20825J3QM67 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm20825J3QM67 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm20825J3QM67 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm20825J3QM67 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm20825J3QM67 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm20825J3QM67 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm20825J3QM67 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm20825J3QM67 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm20825J3QM67 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm20825J3QM67 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm20825J3QM67 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm20825J3QM67 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm20825J3QM67 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm20825J3QM67 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm20825J3QM67 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm20825J3QM67 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm20825J3QM67 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm20825J3QM67 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm20825J3QM67 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm20825J3QM67 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm20825J3QM67 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm20825J3QM67 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm20825J3QM67 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm20825J3QM67 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm20825J3QM67 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm20825J3QM67 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm20825J3QM67 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm20825J3QM67 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm20825J3QM67 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm20825J3QM67 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm20825J3QM67 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm20825J3QM67 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm20825J3QM67 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm20825J3QM67 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm20825J3QM67 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm20825J3QM67 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm20825J3QM67 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm20825J3QM67 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm20825J3QM67 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm20825J3QM67 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm20825J3QM67 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm20825J3QM67 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm20825J3QM67 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm20825J3QM67 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm20825J3QM67 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm20825J3QM67 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm20825J3QM67 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm20825J3QM67 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm20825J3QM67 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm20825J3QM67 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm20825J3QM67 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm20825J3QM67 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm20825J3QM67 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm20825J3QM67 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm20825J3QM67 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm20825J3QM67 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm20825J3QM67 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm20825J3QM67 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm20825J3QM67 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm20825J3QM67 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm20825J3QM67 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm20825J3QM67 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm20825J3QM67 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm20825J3QM67 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm20825J3QM67 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm20825J3QM67 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm20825J3QM67 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm20825J3QM67 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm20825J3QM67 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm20825J3QM67 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm20825J3QM67 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm20825J3QM67 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm20825J3QM67 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm20825J3QM67 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm20825J3QM67 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm20825J3QM67 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm20825J3QM67 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm20825J3QM67 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm20825J3QM67 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm20825J3QM67 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm20825J3QM67 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm20825J3QM67 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm20825J3QM67 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm20825J3QM67 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm20825J3QM67 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm20825J3QM67 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm20825J3QM67 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm20825J3QM67 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm20825J3QM67 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm20825J3QM67 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm20825J3QM67 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm20825J3QM67 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm20825J3QM67 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm20825J3QM67 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm20825J3QM67 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm20825J3QM67 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm20825J3QM67 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm20825J3QM67 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.5 ms