Protein–RNA interactions for Protein: J3QM43

Gm6594, Predicted pseudogene 6594, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6594J3QM43 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm6594J3QM43 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm6594J3QM43 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm6594J3QM43 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm6594J3QM43 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm6594J3QM43 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm6594J3QM43 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm6594J3QM43 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm6594J3QM43 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm6594J3QM43 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm6594J3QM43 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm6594J3QM43 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm6594J3QM43 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm6594J3QM43 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm6594J3QM43 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm6594J3QM43 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm6594J3QM43 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm6594J3QM43 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm6594J3QM43 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm6594J3QM43 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm6594J3QM43 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm6594J3QM43 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm6594J3QM43 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm6594J3QM43 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm6594J3QM43 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm6594J3QM43 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm6594J3QM43 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm6594J3QM43 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm6594J3QM43 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm6594J3QM43 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm6594J3QM43 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm6594J3QM43 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm6594J3QM43 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm6594J3QM43 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm6594J3QM43 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm6594J3QM43 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm6594J3QM43 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm6594J3QM43 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm6594J3QM43 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm6594J3QM43 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm6594J3QM43 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm6594J3QM43 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm6594J3QM43 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm6594J3QM43 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm6594J3QM43 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm6594J3QM43 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm6594J3QM43 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm6594J3QM43 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm6594J3QM43 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm6594J3QM43 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm6594J3QM43 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm6594J3QM43 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm6594J3QM43 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm6594J3QM43 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm6594J3QM43 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm6594J3QM43 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm6594J3QM43 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm6594J3QM43 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm6594J3QM43 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm6594J3QM43 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm6594J3QM43 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm6594J3QM43 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm6594J3QM43 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm6594J3QM43 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm6594J3QM43 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm6594J3QM43 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm6594J3QM43 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm6594J3QM43 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm6594J3QM43 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm6594J3QM43 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm6594J3QM43 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm6594J3QM43 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm6594J3QM43 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm6594J3QM43 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm6594J3QM43 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm6594J3QM43 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm6594J3QM43 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm6594J3QM43 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm6594J3QM43 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm6594J3QM43 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm6594J3QM43 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm6594J3QM43 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm6594J3QM43 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm6594J3QM43 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm6594J3QM43 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm6594J3QM43 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm6594J3QM43 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm6594J3QM43 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm6594J3QM43 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm6594J3QM43 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm6594J3QM43 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm6594J3QM43 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm6594J3QM43 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm6594J3QM43 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm6594J3QM43 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm6594J3QM43 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm6594J3QM43 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm6594J3QM43 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm6594J3QM43 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm6594J3QM43 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms