Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS6

Gm21818, MCG122238, isoform CRA_a, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21818J3KMS6 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm21818J3KMS6 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm21818J3KMS6 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm21818J3KMS6 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm21818J3KMS6 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm21818J3KMS6 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm21818J3KMS6 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm21818J3KMS6 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm21818J3KMS6 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm21818J3KMS6 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm21818J3KMS6 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm21818J3KMS6 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm21818J3KMS6 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm21818J3KMS6 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm21818J3KMS6 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm21818J3KMS6 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm21818J3KMS6 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm21818J3KMS6 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm21818J3KMS6 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm21818J3KMS6 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm21818J3KMS6 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm21818J3KMS6 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm21818J3KMS6 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm21818J3KMS6 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm21818J3KMS6 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm21818J3KMS6 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm21818J3KMS6 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm21818J3KMS6 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm21818J3KMS6 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm21818J3KMS6 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm21818J3KMS6 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm21818J3KMS6 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm21818J3KMS6 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm21818J3KMS6 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm21818J3KMS6 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm21818J3KMS6 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm21818J3KMS6 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm21818J3KMS6 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm21818J3KMS6 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm21818J3KMS6 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm21818J3KMS6 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm21818J3KMS6 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm21818J3KMS6 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm21818J3KMS6 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm21818J3KMS6 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm21818J3KMS6 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm21818J3KMS6 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm21818J3KMS6 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm21818J3KMS6 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm21818J3KMS6 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm21818J3KMS6 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm21818J3KMS6 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm21818J3KMS6 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm21818J3KMS6 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm21818J3KMS6 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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