Protein–RNA interactions for Protein: G5E8C1

Vmn1r67, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r67G5E8C1 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Vmn1r67G5E8C1 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Vmn1r67G5E8C1 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Vmn1r67G5E8C1 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Vmn1r67G5E8C1 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Vmn1r67G5E8C1 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Vmn1r67G5E8C1 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Vmn1r67G5E8C1 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Vmn1r67G5E8C1 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Vmn1r67G5E8C1 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Vmn1r67G5E8C1 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Vmn1r67G5E8C1 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Vmn1r67G5E8C1 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Vmn1r67G5E8C1 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Vmn1r67G5E8C1 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Vmn1r67G5E8C1 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Vmn1r67G5E8C1 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Vmn1r67G5E8C1 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Vmn1r67G5E8C1 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Vmn1r67G5E8C1 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Vmn1r67G5E8C1 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Vmn1r67G5E8C1 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Vmn1r67G5E8C1 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Vmn1r67G5E8C1 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Vmn1r67G5E8C1 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Vmn1r67G5E8C1 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Vmn1r67G5E8C1 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Vmn1r67G5E8C1 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Vmn1r67G5E8C1 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Vmn1r67G5E8C1 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Vmn1r67G5E8C1 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Vmn1r67G5E8C1 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Vmn1r67G5E8C1 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Vmn1r67G5E8C1 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Vmn1r67G5E8C1 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Vmn1r67G5E8C1 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Vmn1r67G5E8C1 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Vmn1r67G5E8C1 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Vmn1r67G5E8C1 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Vmn1r67G5E8C1 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Vmn1r67G5E8C1 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Vmn1r67G5E8C1 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Vmn1r67G5E8C1 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Vmn1r67G5E8C1 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Vmn1r67G5E8C1 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Vmn1r67G5E8C1 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Vmn1r67G5E8C1 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Vmn1r67G5E8C1 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Vmn1r67G5E8C1 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Vmn1r67G5E8C1 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Vmn1r67G5E8C1 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Vmn1r67G5E8C1 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Vmn1r67G5E8C1 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Vmn1r67G5E8C1 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Vmn1r67G5E8C1 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Vmn1r67G5E8C1 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Vmn1r67G5E8C1 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Vmn1r67G5E8C1 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Vmn1r67G5E8C1 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Vmn1r67G5E8C1 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Vmn1r67G5E8C1 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Vmn1r67G5E8C1 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Vmn1r67G5E8C1 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Vmn1r67G5E8C1 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Vmn1r67G5E8C1 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Vmn1r67G5E8C1 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Vmn1r67G5E8C1 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Vmn1r67G5E8C1 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Vmn1r67G5E8C1 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Vmn1r67G5E8C1 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Vmn1r67G5E8C1 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Vmn1r67G5E8C1 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vmn1r67G5E8C1 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vmn1r67G5E8C1 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vmn1r67G5E8C1 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vmn1r67G5E8C1 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vmn1r67G5E8C1 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vmn1r67G5E8C1 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vmn1r67G5E8C1 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vmn1r67G5E8C1 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vmn1r67G5E8C1 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vmn1r67G5E8C1 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vmn1r67G5E8C1 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vmn1r67G5E8C1 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vmn1r67G5E8C1 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vmn1r67G5E8C1 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vmn1r67G5E8C1 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Vmn1r67G5E8C1 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vmn1r67G5E8C1 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vmn1r67G5E8C1 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vmn1r67G5E8C1 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Vmn1r67G5E8C1 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Vmn1r67G5E8C1 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vmn1r67G5E8C1 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Vmn1r67G5E8C1 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Vmn1r67G5E8C1 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Vmn1r67G5E8C1 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vmn1r67G5E8C1 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vmn1r67G5E8C1 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vmn1r67G5E8C1 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.6 ms