Protein–RNA interactions for Protein: G3X9F6

Sh3tc1, SH3 domain and tetratricopeptide repeats 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3tc1G3X9F6 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Sh3tc1G3X9F6 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sh3tc1G3X9F6 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sh3tc1G3X9F6 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Sh3tc1G3X9F6 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sh3tc1G3X9F6 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sh3tc1G3X9F6 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sh3tc1G3X9F6 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sh3tc1G3X9F6 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Sh3tc1G3X9F6 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Sh3tc1G3X9F6 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Sh3tc1G3X9F6 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sh3tc1G3X9F6 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Sh3tc1G3X9F6 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Sh3tc1G3X9F6 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Sh3tc1G3X9F6 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sh3tc1G3X9F6 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Sh3tc1G3X9F6 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Sh3tc1G3X9F6 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Sh3tc1G3X9F6 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Sh3tc1G3X9F6 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sh3tc1G3X9F6 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sh3tc1G3X9F6 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sh3tc1G3X9F6 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sh3tc1G3X9F6 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sh3tc1G3X9F6 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Sh3tc1G3X9F6 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sh3tc1G3X9F6 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sh3tc1G3X9F6 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sh3tc1G3X9F6 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sh3tc1G3X9F6 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Sh3tc1G3X9F6 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Sh3tc1G3X9F6 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sh3tc1G3X9F6 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Sh3tc1G3X9F6 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sh3tc1G3X9F6 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sh3tc1G3X9F6 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sh3tc1G3X9F6 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sh3tc1G3X9F6 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sh3tc1G3X9F6 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sh3tc1G3X9F6 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sh3tc1G3X9F6 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sh3tc1G3X9F6 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sh3tc1G3X9F6 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Sh3tc1G3X9F6 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sh3tc1G3X9F6 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sh3tc1G3X9F6 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Sh3tc1G3X9F6 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sh3tc1G3X9F6 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Sh3tc1G3X9F6 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sh3tc1G3X9F6 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sh3tc1G3X9F6 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Sh3tc1G3X9F6 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sh3tc1G3X9F6 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Sh3tc1G3X9F6 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Sh3tc1G3X9F6 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sh3tc1G3X9F6 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Sh3tc1G3X9F6 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sh3tc1G3X9F6 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sh3tc1G3X9F6 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Sh3tc1G3X9F6 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sh3tc1G3X9F6 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sh3tc1G3X9F6 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Sh3tc1G3X9F6 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sh3tc1G3X9F6 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sh3tc1G3X9F6 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Sh3tc1G3X9F6 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Sh3tc1G3X9F6 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sh3tc1G3X9F6 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sh3tc1G3X9F6 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sh3tc1G3X9F6 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sh3tc1G3X9F6 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sh3tc1G3X9F6 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sh3tc1G3X9F6 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sh3tc1G3X9F6 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Sh3tc1G3X9F6 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sh3tc1G3X9F6 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sh3tc1G3X9F6 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Sh3tc1G3X9F6 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sh3tc1G3X9F6 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sh3tc1G3X9F6 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sh3tc1G3X9F6 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Sh3tc1G3X9F6 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Sh3tc1G3X9F6 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sh3tc1G3X9F6 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sh3tc1G3X9F6 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sh3tc1G3X9F6 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sh3tc1G3X9F6 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sh3tc1G3X9F6 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sh3tc1G3X9F6 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sh3tc1G3X9F6 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sh3tc1G3X9F6 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sh3tc1G3X9F6 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Sh3tc1G3X9F6 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sh3tc1G3X9F6 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sh3tc1G3X9F6 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sh3tc1G3X9F6 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sh3tc1G3X9F6 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sh3tc1G3X9F6 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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