Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Ndufb5-204ENSMUST00000127477 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Gm18123-201ENSMUST00000210874 822 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Gm18968-201ENSMUST00000221319 862 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Ice2-202ENSMUST00000117246 1201 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Hoxd3os1-203ENSMUST00000145799 511 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Gm45410-201ENSMUST00000211331 1093 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 1810013D15Rik-201ENSMUST00000029827 300 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Gm6304-201ENSMUST00000096579 447 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Gm31138-201ENSMUST00000212296 1705 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Bola3-203ENSMUST00000122216 554 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Gm15506-201ENSMUST00000148776 1133 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 2810049E08Rik-201ENSMUST00000185600 1102 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 3110009M11Rik-201ENSMUST00000208647 892 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Prok2-201ENSMUST00000008273 594 ntTSL 3 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 EU599041-202ENSMUST00000205291 1386 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 AC159810.1-201ENSMUST00000214838 1480 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Gm14232-201ENSMUST00000137176 446 ntTSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Gm12069-201ENSMUST00000145127 806 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Snhg17-205ENSMUST00000151331 529 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 6530401F13Rik-201ENSMUST00000166971 1090 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Gm29304-201ENSMUST00000186555 695 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Gm29223-201ENSMUST00000188867 695 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Gm37921-201ENSMUST00000194333 695 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Mrpl30-207ENSMUST00000195373 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Gm43997-201ENSMUST00000203986 1005 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms